“十一五”我省农作物及畜禽育种攻关“主要作物基因资源收集保存、发掘与优异新种质创制”、“主要畜禽遗传资源发掘、保存与创新”、“主要农作物病虫害抗性鉴定和选育技术”、“农作物新品种区域试验”、“突破性作物新品种高产高效栽培技术研究”和“育种信息服务”等6个公共服务课题，取得了显著成效。
在作物资源方面，从国内外收（征）集主要作物基因资源7830份，翻种更新基因资源10322份，评价鉴定出优质、抗病、抗逆优异资源682份，标记重要功能基因15个，创制出一批具有重大育种应用前景的新材料61份。
在畜禽资源方面，开发出四川家禽遗传资源多样性数据库和动态监测软件管理系统；开展了藏猪、草科鸡等优良地方品种遗传多样性及功能基因研究，克隆和定位了家禽特异候选基因8个；完成了猪68个重要基因的检测及表达分析，筛选出有重要调控作用的30个miRNA和21个细胞因子。
在抗性鉴定方面，监测到4种病菌的新强毒性类型，明确了18个抗病基因在四川的有效性；鉴定、标记抗性基因和位点19个；对39万余份次育种中间材料进行了抗性筛选，建立、规范抗性鉴定方法16项，推导了730个品种的抗性基因型，并对2100多个（次）生产品种进行了抗性丧失监测。
在品种区试方面，组织开展了水稻、玉米等9个农作物5121个新品种试验，在全省设立了500余个试验点，通过3056个试验点（次）的试验，向省品审会推荐报审主要粮食作物品种366个，审定通过品种354个。
在共性技术和信息服务方面，筛选出主导品种40个，创新集成共性栽培技术模式23套。搭建了国内第一个“技术+资源+服务”的“一站式”育种攻关数据共享平台，网络浏览量近百万人次，获国家软件著作权证书。
